中国中医科学院医学实验中心
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    中国中医科学院医学实验中心成立于2006年3月,是由科技部、财政部、中编办和国家中医药管理局批准成立的公益性中医药科研机构。拥有北京市中医药防治重大疾病重点实验室、首都科技条件平台开放单位、国家基因组科学数据中心中医药分中心、“中药复杂作用解析”湖北省重点实验室等。中医药智能工程中心挂靠医学实验中心建设。

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    医学实验中心中医药实验技术共享服务平台以大型科学仪器设备和前沿科学技术手段为支撑,紧跟现代科技前沿,打造标签技术、创新功能单元,形成稳定的中医药实验科学和技术研究团队,服务我院以及行业内外相关企业、院所、高校。平台下设物质分析检测、微透析、分子生物学、免疫学、机能、形态学、细胞与微生物学、骨与关节疾病实验室及四诊信息研究室9个功能实验室。

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微滴式数字PCR系统

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  该设备为Bio-Rad公司的 QX200微滴式数字PCR系统。数字PCR技术是一种新型的PCR检测技术,与普通PCR技术(第一代)、real-time PCR技术(第二代)相比,其具有更高精确度、准确性和灵敏度,被称为第三代PCR技术。该技术定量的结果不依赖Cq值,而是直接给出靶序列的起始拷贝数浓度,实现真正意义上的绝对定量。微滴式数字PCR系统是Bio-Rad开发的具有领先地位的数字PCR设备。其统可将含有核酸分子的荧光PCR反应体系分割成数万个纳升级微滴,每个微滴独立反应。扩增完毕后逐个对每个微滴进行荧光信号检测,将荧光模拟信号数字化。

  应用范围

  其主要功能主要包括:

  1.基因表达差异研究

  靶基因表达差异微小或表达水平低,例如microRNA、lncRNAs、等位基因的不平衡表达,单细胞基因表达分析。

  2.基因组学及表观遗传学的研究

  特别适用于拷贝数变异(CNV)、稀有序列、甲基化水平分析。对于低丰度目标序列,由于DNA干扰,提纯率、转化效率、降解等影响,常规方法无法检测此类样本,只能依靠数字PCR技术。

  3.第三方医学检测

  ① 数字PCR的超高灵敏度可对外周血中肿瘤游离DNA进行检测,对肿瘤的发现远早于影像学及其他蛋白或多糖类肿瘤标记物的检测手段。体液样本中正常体细胞DNA的量是远大于肿瘤细胞DNA的量,会湮没对肿瘤细胞DNA的检测信号。数字PCR系统可以规避这些不利因素,实现对肿瘤标记物的有效检测,灵敏度可达 0.0001%,定量监测突变频率。

  ② 无创产前检查。通过检测母体外周血标记游离胎儿DNA/RNA,在基因水平对各种遗传疾病准确检测。在经济性和可操作性上远胜于二代测序。

  4.病原微生物检测、环境监测、食品安全及转基因成分的检测、NGS 测序。这些测试项目均依赖数字PCR系统的高效、精确而得以实现

   应用案例

  1.肿瘤筛查  qPCR无法检测到血清中肝癌标志物TUC339,而ddPCR在miRNA 0.5ng/μl条件下依然能够检出,约为1.4 copy/106 EV

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  2.病毒筛查  131例肝癌病人FFPE样本,27例正常DNA作为阴性对照组。对131例样本按照TNM、BCLC进行分期,利用ddPCR进行HBV cccDNA检测。QPCR检测阳性率非常低,ddPCR对131个FFPE样品中全部实现了HBV检出,检测浓度范围是1.1-175.5 copy/μl

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  3.双通道检测H7N9病毒

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  4. 病毒的野生型突变检测

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